En los perfiles galvanizados sometidos a procesos de corte con cizallas o con punzones ¿La capa de aleación de Zn continúa protegiendo al material base?

Sí. La protección continúa porque la capa de Zn actúa por protección galvánica aunque la película se rompa por el corte o el punzonado. Los procesos de corte no afectan la propiedad anticorrosiva del material galvanizado.